L’individuazione dei singoli progetti da sostenere viene coordinata con la proprietà delle Isole, la direzione e la commissione scientifica. In questo processo l’Associazione pone l'accento su alcune aree principali: (i) collezioni e botanica scientifica, (ii) valore storico e paesaggistico (iii), divulgazione e didattica e (iv) sostenibilità finanziaria a lungo termine.

Il rilancio del Giardino Botanico presuppone la presenza di un responsabile che, con le necessarie competenze e adeguati supporti (tra cui il curatore e la commissione scientifica), assuma un ruolo trainante a tutto campo.